南京大学第四轮学科评估于2016年4月启动,按照“自愿申请、免费参评”原则,采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行。评估体系在前三轮的基础上进行诸多创新;评估数据以“公共数据和单位填报相结合”的方式获取;评估结果按“分档”方式呈现,具体方法是按“学科整体水得分”的位次百分位,将前70%的学科分9档公布:前2%(或前2名)为A+,2%~5%为A(不含2%,下同),5%~10%为A-,10%~20%为B+,20%~30%为B,30%~40%为B-,40%~50%为C+,50%~60%为C,60%~70%为C-。

| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 10284 | 南京大学 | 天文学 | A+ |
| 2 | 10284 | 南京大学 | 地质学 | A+ |
| 3 | 10284 | 南京大学 | 图书情报与档案管理 | A+ |
| 4 | 10284 | 南京大学 | 哲学 | A |
| 5 | 10284 | 南京大学 | 社会学 | A |
| 6 | 10284 | 南京大学 | 中国语言文学 | A |
| 7 | 10284 | 南京大学 | 外国语言文学 | A |
| 8 | 10284 | 南京大学 | 中国史 | A |
| 9 | 10284 | 南京大学 | 物理学 | A |
| 10 | 10284 | 南京大学 | 生物学 | A |
| 11 | 10284 | 南京大学 | 计算机科学与技术 | A |
| 12 | 10284 | 南京大学 | 环境科学与工程 | A |
| 13 | 10284 | 南京大学 | 软件工程 | A |
| 14 | 10284 | 南京大学 | 工商管理 | A |
| 15 | 10284 | 南京大学 | 理论经济学 | A- |
| 16 | 10284 | 南京大学 | 法学 | A- |
| 17 | 10284 | 南京大学 | 数学 | A- |
| 18 | 10284 | 南京大学 | 化学 | A- |
| 19 | 10284 | 南京大学 | 地理学 | A- |
| 20 | 10284 | 南京大学 | 生态学 | A- |
| 21 | 10284 | 南京大学 | 电子科学与技术 | A- |
| 22 | 10284 | 南京大学 | 应用经济学 | B+ |
| 23 | 10284 | 南京大学 | 政治学 | B+ |
| 24 | 10284 | 南京大学 | 马克思主义理论 | B+ |
| 25 | 10284 | 南京大学 | 新闻传播学 | B+ |
| 26 | 10284 | 南京大学 | 考古学 | B+ |
| 27 | 10284 | 南京大学 | 世界史 | B+ |
| 28 | 10284 | 南京大学 | 材料科学与工程 | B+ |
| 29 | 10284 | 南京大学 | 城乡规划学 | B+ |
| 30 | 10284 | 南京大学 | 管理科学与工程 | B+ |
| 31 | 10284 | 南京大学 | 公共管理 | B+ |
| 32 | 10284 | 南京大学 | 大气科学 | B |
| 33 | 10284 | 南京大学 | 光学工程 | B |
| 34 | 10284 | 南京大学 | 信息与通信工程 | B |
| 35 | 10284 | 南京大学 | 建筑学 | B |
| 36 | 10284 | 南京大学 | 地质资源与地质工程 | B |
| 37 | 10284 | 南京大学 | 统计学 | B- |
| 38 | 10284 | 南京大学 | 水利工程 | B- |
| 39 | 10284 | 南京大学 | 海洋科学 | C+ |
| 40 | 10284 | 南京大学 | 生物医学工程 | C+ |
| 41 | 10284 | 南京大学 | 控制科学与工程 | C |
南京大学拥有一支高素质的师资队伍,其中包括中国科学院院士28人,中国工程院院士5人,国家级领军人才327人次,国家级青年人才347人次,国家科技重大专项、“973计划”、“863计划”、国家重点研发计划等重大项目首席科学家103人次,国务院学位委员会学科评议组成员22人,国家级教学名师11人,“百千万人才工程”国家级人选38人。
春风化雨、桃李芬芳。在过去的一个多世纪中,南京大学始终坚持育人为本,在各个历史阶段培养和造就了众多中华英才,他们在各自的领域建功立业、成就卓著。改革开放以来,南京大学在教育教学改革中进行了多方面的探索,形成了许多重要的教育和教学理念,在国内外高等教育界产生了重要的影响。当前,南京大学提出了“办中国最好的本科教育”的奋斗目标,坚持“学科建设与本科教学融通,通识教育与个性化培养融通,拓宽基础与强化实践融通,学会學習与学会做人融通” 的人才培养理念,不断深化创新人才培养机制改革,积极为社会各行各业培养具有创新精神、实践能力和国际视野的未来领军人才和拔尖创新人才。
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