南京工业大学第四轮学科评估于2016年4月启动,按照“自愿申请、免费参评”原则,采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行。评估体系在前三轮的基础上进行诸多创新;评估数据以“公共数据和单位填报相结合”的方式获取;评估结果按“分档”方式呈现,具体方法是按“学科整体水得分”的位次百分位,将前70%的学科分9档公布:前2%(或前2名)为A+,2%~5%为A(不含2%,下同),5%~10%为A-,10%~20%为B+,20%~30%为B,30%~40%为B-,40%~50%为C+,50%~60%为C,60%~70%为C-。

| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 10291 | 南京工业大学 | 化学工程与技术 | A |
| 2 | 10291 | 南京工业大学 | 材料科学与工程 | B+ |
| 3 | 10291 | 南京工业大学 | 安全科学与工程 | B+ |
| 4 | 10291 | 南京工业大学 | 动力工程及工程热物理 | B |
| 5 | 10291 | 南京工业大学 | 土木工程 | B |
| 6 | 10291 | 南京工业大学 | 轻工技术与工程 | B |
| 7 | 10291 | 南京工业大学 | 控制科学与工程 | C+ |
| 8 | 10291 | 南京工业大学 | 环境科学与工程 | C+ |
| 9 | 10291 | 南京工业大学 | 城乡规划学 | C+ |
| 10 | 10291 | 南京工业大学 | 药学 | C+ |
| 11 | 10291 | 南京工业大学 | 化学 | C |
| 12 | 10291 | 南京工业大学 | 建筑学 | C |
| 13 | 10291 | 南京工业大学 | 管理科学与工程 | C |
| 14 | 10291 | 南京工业大学 | 工商管理 | C |
| 15 | 10291 | 南京工业大学 | 机械工程 | C- |
| 16 | 10291 | 南京工业大学 | 软件工程 | C- |
学校现有教职工3000余人,拥有高级职称人员1500余人,其中中国科学院院士3人、中国工程院院士7人、第七届国务院学科评议组成员2人、第八届国务院学科评议组成员1人、国家级人才132人次,国家级高层次人才团队13个,省部级重点高层次人才139人次,省部级重点高层次团队35个。
学校坚持为党育人、为国育才,获表彰的全国先进基层党组织1个,全国党建工作“标杆院系”“样板支部”数与培育创建数位居省属高校第一,涌现出首批全国高校黄大年式教师团队等先进典型。学校加强“新工科”建设,23个工科专业通过工程教育专业认证或住建部专业评估,进入全球工程教育“第一方阵”。学校注重拔尖创新人才培养,建设书院制“2011学院”,与中科院相关院所共建“英才班”。“十一五”以来,获国家级教学成果二等奖4项,省级教学成果特等奖3项、一等奖7项,二等奖12项。现有国家级教学团队2个、国家级实验教学示范中心1个、国家级精品教材1部、“十二五”国家级规划教材8部、国家级一流本科专业建设点24个、国家级专业建设点12个、教育部专业综合改革试点2个、教育部卓越工程师教育培养计划试点专业7个、国家级精品课程3门、国家级双语教学示范课程2门、国家级精品资源共享课2门、国家级一流本科课程9门、首批国家级课程思政示范课程2门、全国教材建设奖全国优秀教材(高等教育类)1项、首批江苏省研究生优秀教材2部、江苏省一流本科专业建设点7个、江苏高校品牌专业建设工程一期项目5个、江苏省品牌专业8个、江苏省专业10个、江苏省重点专业类12个(涵盖30个专业)、江苏省卓越工程师教育培养计划(软件类)试点专业2个、省实验教学示范中心18个、江苏省课程思政建设示范课程4门。2006年学校获得教育部组织的本科教学工作水评估优秀等级,2016年顺利通过教育部本科教学工作审核评估。2017年获批教育部首批中美青年创客交流中心。多年来学校已经培养出20多位省部级以上领导干部、30多位两院院士、100多位央企和上市公司领导,为社会输送了大批高质量人才。
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